10月21日，民航局对上海虹桥机场“10·11”事件相关责任单位领导和责任人作出严肃处理，要求全行业深刻汲取教训，举一反三，全面排查隐患，决不放过一个漏洞。民航局强调，民航工作必须坚持飞行安全底线，对安全隐患必须坚持“零容忍”原则。

10月11日中午，东航一架空客A320客机在起飞滑行过程中发现同公司另一架空客A330客机正在穿越跑道，而此前塔台并未提示。事后民航局连夜展开调查，将此事认定为最严重的A类跑道侵入事件。

经调查，民航局认定该事件是一起因塔台管制员遗忘动态、指挥失误而造成的人为原因严重事故征候，分别给予华东空管局、华东空管局管制中心、华东空管局安全管理部13名领导干部党内警告、严重警告和行政记过、撤职处分；吊销当班指挥席和监控席管制员执照，当班指挥席管制员终身不得从事管制指挥工作；对成功化解危机的东航A320客机当班机长何超记一等功并给予相应奖励。

民航局还于当天约谈了空管局领导班子，严肃指出了空管系统在“10·11”不安全事件中暴露出的问题，要求空管系统坚持问题导向，盯住问题多发的重点区域、重点单位，切实落实安全领导责任、安全主体责任、安全岗位责任，抓基层、打基础、苦练基本功，发挥安全体系作用，防止重复性问题多发。